El Archivo Histórico Nacional, creado en 1884 en Quito por decreto de José María Plácido Caamaño, es el principal custodio del patrimonio documental ecuatoriano. Se trata de un repositorio creado especialmente para custodiar, conservar y restaurar todos los fondos documentales relacionados con la historia del Ecuador, desde el siglo XVI al XXI. Depende del Ministerio de Cultura y Patrimonio y preserva documentos de 1538 a 1990, incluyendo materiales sobre pueblos indígenas (Kichwa, Puruhá). Actualmente, contiene tres sedes diferenciadas: la Zonal de Tungurahua, la Zonal Alausí, y la principal, la sede de Quito, que alberga 25 fondos documentales en 4 repositorios.
La sede quiteña contiene cuatro repositorios, con 20 fondos documentales y 4 colecciones.
Con sedes en Quito, Ambato y Alausí, su página web (www.culturaypatrimonio.gob.ec) ofrece catálogos digitales, siendo un recurso esencial para etnohistoria y memoria social.
El Archivo Metropolitano de Historia de Quito es una institución especializada en la conservación, catalogación y difusión del patrimonio documental de la ciudad desde el siglo XVI hasta el siglo XX. Su sede se encuentra en el antiguo Hospital San Juan de Dios, en el Centro Histórico de Quito, y custodia un acervo fundamental para el estudio de la historia urbana, social, económica, política y cultural de la capital ecuatoriana. Entre sus fondos más relevantes se encuentran documentos coloniales (desde 1534), actas del Cabildo, registros notariales, planos arquitectónicos, colecciones fotográficas y archivos privados de personajes e instituciones quiteñas. Este archivo constituye un centro de referencia imprescindible para la investigación histórica y patrimonial de la ciudad y de la región andina en general.
La Casa de la Cultura Ecuatoriana es una institución que busca conservar y poner en valor la identidad cultural de las comunidades existentes en el Ecuador. Se crea en 1944, primero como Biblioteca para conservar y difundir la producción intelectual ecuatoriana, y posteriormente como institución que alberga galerías de arte y espacios de difusión cultural de todo tipo.
El Museo Hambatu' es el museo de la ciudad de Ambato, en la provincia de Tungurahua. Es un museo muy reciente y donde se puede realizar un recorrido histórico sobre la historia de Ambato desde las culturas prehispánicas hasta la actualidad.
No es un centro de investigadores, está abierto al público pero es un centro cultural sobre aprender sobre las comunidades de la zona así como de la artesanía y producción artística de dichas comunidades.
La Biblioteca de la Universidad Andina Simón Bolívar es un centro de información clave para la investigación y la formación académica de posgrado en la región andina. Situada en el edificio Eugenio Espejo, ocupa tres pisos con más de 200 puestos de trabajo, cubículos individuales y grupales, salas multimedia y una sonoteca. Su colección incluye más de 140,000 obras físicas y digitales, y gestiona el repositorio institucional UASB-Digital, que ofrece acceso abierto a tesis, publicaciones y revistas académicas. Además, facilita el acceso a bases de datos especializadas y recursos de información propios y suscritos, apoyando así la labor de estudiantes, docentes e investigadores en diversas áreas del conocimiento .
El Museo Plutarco Naranjo Vargas, ubicado en la Universidad Andina Simón Bolívar en Quito, alberga más de 2.100 piezas arqueológicas recolectadas por el científico Plutarco Naranjo. La colección, que data desde el 3.500 a.C., combina arqueología, etnografía y arte con investigaciones sobre la medicina ancestral, mostrando su vínculo con prácticas tradicionales actuales. El museo ofrece nueve exposiciones temáticas sobre la diversidad natural, las culturas prehispánicas y las plantas sagradas utilizadas en rituales.