La Biblioteca Ecuatoriana Aurelio Espinosa Pólit, fundada en 1955 en Quito por el sacerdote jesuita y humanista Aurelio Espinosa Pólit, constituye una de las principales instituciones dedicadas a la preservación, investigación y difusión del patrimonio bibliográfico y documental del Ecuador. Su acervo supera los 250.000 volúmenes e incluye una amplia variedad de materiales: libros antiguos y modernos, manuscritos, periódicos, revistas, fotografías, mapas y archivos personales. Entre sus fondos documentales más relevantes se encuentran los archivos de figuras destacadas como Juan Montalvo, Pedro Fermín Cevallos y Benjamín Carrión, así como una valiosa colección de primeras ediciones de obras fundamentales de la literatura y el pensamiento ecuatoriano. La biblioteca cuenta además con una hemeroteca especializada, convirtiéndose en un centro de referencia imprescindible para investigadores en las áreas de historia, literatura, política y cultura ecuatoriana.
El Museo Hambatu' es el museo de la ciudad de Ambato, en la provincia de Tungurahua. Es un museo muy reciente y donde se puede realizar un recorrido histórico sobre la historia de Ambato desde las culturas prehispánicas hasta la actualidad.
No es un centro de investigadores, está abierto al público pero es un centro cultural sobre aprender sobre las comunidades de la zona así como de la artesanía y producción artística de dichas comunidades.
La Biblioteca de la Universidad Andina Simón Bolívar es un centro de información clave para la investigación y la formación académica de posgrado en la región andina. Situada en el edificio Eugenio Espejo, ocupa tres pisos con más de 200 puestos de trabajo, cubículos individuales y grupales, salas multimedia y una sonoteca. Su colección incluye más de 140,000 obras físicas y digitales, y gestiona el repositorio institucional UASB-Digital, que ofrece acceso abierto a tesis, publicaciones y revistas académicas. Además, facilita el acceso a bases de datos especializadas y recursos de información propios y suscritos, apoyando así la labor de estudiantes, docentes e investigadores en diversas áreas del conocimiento .
El Banco de Datos del INEC, ubicado en Quito, es el repositorio digital del Instituto Nacional de Estadística y Censos, fundado en 1976. Recopila datos estadísticos sociodemográficos, económicos y ambientales, incluyendo información sobre pueblos indígenas como Kichwa, Shuar y Waorani. Contiene fuentes primarias como registros censales y encuestas. Su plataforma en línea (www.ecuadorencifras.gob.ec), ofrece acceso abierto a bases de datos, siendo un recurso clave para investigadores de etnohistoria y políticas públicas indígenas.
El Museo Abya Yala, gestionado por la Universidad Politécnica Salesiana en Quito, fundado en 1957 como Museo Shuar por misioneros salesianos, preserva el patrimonio cultural indígena, especialmente amazónico (Shuar, Kichwa, Waorani). Su archivo incluye fuentes primarias como grabaciones de tradiciones orales, etnografías y objetos culturales. La base de datos del Centro Cultural Abya Yala, parcialmente digitalizada, es accesible en www.ups.edu.ec. Es un recurso clave para investigadores de etnohistoria y antropología indígena.
La Fundación Pueblo Indio del Ecuador, establecida en 1978 en Quito, promueve el desarrollo y los derechos de pueblos indígenas, como los Kichwa y Waorani. Su archivo incluye fuentes primarias como informes de proyectos, testimonios y grabaciones de tradiciones orales. Su base de datos en línea ofrece acceso a documentos digitalizados, siendo un recurso para investigadores de etnohistoria y desarrollo comunitario.